Arife Elif KÜÇÜKÇAKIR

Yürümek mi, Dönmek mi? Beynin Hareket Komutlarını Işıkla Çözmek

Yürümek, yön değiştirmek ve yavaşlamak gibi hareketler ne kadar doğal görünse de beynin bunu nasıl yönettiği karmaşık katmanlı süreçtir. Son yıllarda ilgi gören optogenetik teknikler ile beynin belirli bölgeleri ışık kullanılarak doğrudan uyarılabilmekte ve bu bölgelerin davranış üzerindeki etkileri anlık olarak izlenebilmektedir [1]. Frontiers in Neural Circuits dergisinde yayımlanan bir çalışmada [2] , farelerin beynindeki […]

Yürümek mi, Dönmek mi? Beynin Hareket Komutlarını Işıkla Çözmek Read More »

Metamorfozun Moleküler Temelleri

Bir morfolojik ve fizyolojik değişim süreci olan metamorfoz ya da başkalaşım, hormonlarla kontrol edilen bir süreçtir. Metamorfoz sürecine sahip en çok bilinen canlılar; böcekler ve amfibilerdir. Ayrıca, bazı balıklar ve birçok deniz omurgasızı da yaygın olarak bilinmektedir. Metamorfoz teriminin çiçekli bitkiler, mantarlar, ve bazı deniz yosunları gibi hayvan olmayan yapılar için geçerli olup olamayacağı konusunda

Metamorfozun Moleküler Temelleri Read More »

ANTİK DNA: Arkeolojik Bitki Kalıntıları ve Buğday

Antik DNA (aDNA), binlerce yıl önce yaşamış canlıların fosil ya da kurumuş kalıntılarından elde edilen kısa ve izole DNA dizileridir. Zamanla sıcaklık, nem, mikroorganizma gibi etkenlerden dolayı zarar görebilen antik DNA genellikle kemikler, dişler, polen, tohum gibi doğal ve arkeolojik örneklerden elde edilir. Antik DNA çalışmaları sayesinde birhastalığın nedeninin kökenlerinin, nesli tükenen canlıların, insan evriminin

ANTİK DNA: Arkeolojik Bitki Kalıntıları ve Buğday Read More »

Sıfırdan Yapay Protein Tasarımı: EsmGFP

Protein mühendisliği ve yapay zeka alanında 2025 yılının gelecek vadeden çalışmalardan biri olan EsmGFP(Evolutionarily simulated green fluorescent protein), ESM–3 (Evolutionary Scale Modeling 3) adlı bir AI modeli kullanılarak doğada mevcut olmayan ve 500 milyon yıllık moleküler evrimin taklit edilmesi ile tasarlanmış yeşil floresan proteinidir. EvolutionaryScale ve Arc Enstitüsü’nde protein yapı ve tahmin için geliştirilen AI

Sıfırdan Yapay Protein Tasarımı: EsmGFP Read More »

Antik DNA: mtDNA ve Araştırmalardaki Zorluklar

Arkeolojik ve antropolojik bulgular; evrim, göç hareketleri, bir hastalığın kökeni, insanın yaşamı ve gelişimi hakkında somut veriler sunar. İnsan kalıntılarından elde edilen mtDNA ve binlerce yıl önce yaşamış organizmalardan elde edilen antik DNA incelemeleri, bu bulguların halkalarını büyük ölçüde genişletir. Bir hastalığın nedeninin kökenlerinden, nesli tükenen canlıların tespit edilmesine kadar pek çok önemli çalışmada antik

Antik DNA: mtDNA ve Araştırmalardaki Zorluklar Read More »